Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01641 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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