Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ifnb1P01575 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms