Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnk4O88454 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kcnk4O88454 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnk4O88454 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnk4O88454 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnk4O88454 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnk4O88454 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnk4O88454 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnk4O88454 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnk4O88454 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms