Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cd46O88174 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms