Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cbx4O55187 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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