Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl35aO55142 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl35aO55142 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms