Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Copb2O55029 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Copb2O55029 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copb2O55029 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copb2O55029 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms