Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms