Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SlkO54988 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlkO54988 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlkO54988 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlkO54988 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlkO54988 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlkO54988 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlkO54988 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlkO54988 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlkO54988 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlkO54988 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SlkO54988 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SlkO54988 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlkO54988 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SlkO54988 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlkO54988 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlkO54988 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlkO54988 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlkO54988 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlkO54988 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlkO54988 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlkO54988 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlkO54988 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlkO54988 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlkO54988 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlkO54988 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlkO54988 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlkO54988 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlkO54988 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlkO54988 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlkO54988 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SlkO54988 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlkO54988 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlkO54988 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlkO54988 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlkO54988 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlkO54988 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlkO54988 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlkO54988 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlkO54988 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms