Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnk2O54967 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.6 ms