Protein–RNA interactions for Protein: O54962

Banf1, Barrier-to-autointegration factor, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Banf1O54962 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Banf1O54962 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Banf1O54962 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Banf1O54962 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Banf1O54962 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Banf1O54962 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms