Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f6O54917 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f6O54917 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2f6O54917 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2f6O54917 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2f6O54917 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2f6O54917 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E2f6O54917 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2f6O54917 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2f6O54917 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2f6O54917 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.02■□□□□ -0
E2f6O54917 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E2f6O54917 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.02■□□□□ -0
E2f6O54917 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.02■□□□□ -0
E2f6O54917 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2f6O54917 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2f6O54917 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2f6O54917 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2f6O54917 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
E2f6O54917 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms