Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DffaO54786 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DffaO54786 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DffaO54786 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DffaO54786 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DffaO54786 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DffaO54786 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffaO54786 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DffaO54786 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffaO54786 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffaO54786 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffaO54786 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffaO54786 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffaO54786 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffaO54786 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffaO54786 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DffaO54786 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffaO54786 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffaO54786 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffaO54786 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffaO54786 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffaO54786 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffaO54786 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffaO54786 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffaO54786 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffaO54786 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffaO54786 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffaO54786 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffaO54786 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffaO54786 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffaO54786 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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