Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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