Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf12O35738 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf12O35738 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf12O35738 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms