Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lhx8O35652 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lhx8O35652 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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