Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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H2-ObO35424 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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H2-ObO35424 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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H2-ObO35424 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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H2-ObO35424 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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H2-ObO35424 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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H2-ObO35424 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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H2-ObO35424 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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H2-ObO35424 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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H2-ObO35424 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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