Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf11aO35305 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf11aO35305 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms