Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Ptpn9O35239 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ptpn9O35239 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ptpn9O35239 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ptpn9O35239 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ptpn9O35239 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ptpn9O35239 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ptpn9O35239 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ptpn9O35239 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ptpn9O35239 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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