Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casq1O09165 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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