Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22bO08547 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22bO08547 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22bO08547 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22bO08547 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22bO08547 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22bO08547 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22bO08547 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22bO08547 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22bO08547 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22bO08547 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22bO08547 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22bO08547 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22bO08547 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22bO08547 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22bO08547 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22bO08547 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22bO08547 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22bO08547 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22bO08547 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec22bO08547 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sec22bO08547 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec22bO08547 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sec22bO08547 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec22bO08547 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec22bO08547 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22bO08547 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22bO08547 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22bO08547 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22bO08547 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sec22bO08547 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sec22bO08547 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22bO08547 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22bO08547 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22bO08547 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22bO08547 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22bO08547 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22bO08547 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22bO08547 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22bO08547 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec22bO08547 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec22bO08547 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec22bO08547 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec22bO08547 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sec22bO08547 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec22bO08547 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec22bO08547 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec22bO08547 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec22bO08547 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms