Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna5O08543 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna5O08543 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Efna5O08543 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna5O08543 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna5O08543 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna5O08543 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms