Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C0

Gm6401, Predicted gene 6401 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6401L7N2C0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6401L7N2C0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms