Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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