Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Gm3542K7N6U2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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Gm3542K7N6U2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3542K7N6U2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm3542K7N6U2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm3542K7N6U2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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