Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm5849J3QPE5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm5849J3QPE5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm5849J3QPE5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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