Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8356J3QPD3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms