Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20795J3QP49 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms