Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34c2J3QNM1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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