Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms