Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gm20918J3QN17 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gm20918J3QN17 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Gm20918J3QN17 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Gm20918J3QN17 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Gm20918J3QN17 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20918J3QN17 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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