Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3415J3QMS8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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