Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK1

Sgo2b, Shugoshin 2B, mousemouse

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Length 1,167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2bJ3QMK1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2bJ3QMK1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms