Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930544D05RikJ3QK56 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms