Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem200cJ3QK46 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms