Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Cldn34c3J3QJW5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Cldn34c3J3QJW5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34c3J3QJW5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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