Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21818J3KMS6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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