Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AK157302I3ITR1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms