Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf4bG5E8Z2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms