Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms