Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3tc1G3X9F6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms