Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms