Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arid4aF8VPQ2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms