Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atf6F6VAN0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms