Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptbn5F6UCX4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms