Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28305F6U473 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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