Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngap1F6SEU4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms