Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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