Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

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Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Herc6F2Z461 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Herc6F2Z461 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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