Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D3

Ccdc121, Coiled-coil domain-containing 121, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc121E9Q6D3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc121E9Q6D3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc121E9Q6D3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc121E9Q6D3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc121E9Q6D3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc121E9Q6D3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc121E9Q6D3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc121E9Q6D3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc121E9Q6D3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc121E9Q6D3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc121E9Q6D3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc121E9Q6D3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc121E9Q6D3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc121E9Q6D3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc121E9Q6D3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc121E9Q6D3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc121E9Q6D3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms